Оставлять как есть, НЕЛЬЗЯ, канал должен быть загильзован полностью, от котла до окончания дымохода.
Часть квадратной трубы которая осталась на улице, нужно протолкнуть или обрезать, так как гильзовка канала заканчивается окончанием дымохода (или переходником на трубу ТЕРМО, как должно быть в Вашем случае).
Кроме того, гильза должна входить в канал не плотно, а как минимум в 1см от кирпича.