Вы совершенно правы, соединения промазывал битумным герметиком для крыш "Penosil" и им же к рубероиду. И когда буду стелить рубероид по плоской поверхности, думаю делать напуск на оцинковку.
А вообще мне очень не нравится глубина и вертикальные части ендовы. Сколько раз строители не стелили на вертикальные части губероид, каждое лето он отставал и образовывались протёчки, а зимой это всё усугублялось от морозов. Вот я и решил вертикальные части ендовы убрать.